MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011982	TTC	2	6	75368	75373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080173
1002	NC_011982	CG	3	6	75444	75449	0 %	0 %	50 %	50 %	222080173
1003	NC_011982	AAG	2	6	75517	75522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080173
1004	NC_011982	GC	4	8	75525	75532	0 %	0 %	50 %	50 %	222080173
1005	NC_011982	CACGA	2	10	75550	75559	40 %	0 %	20 %	40 %	222080173
1006	NC_011982	TCA	2	6	75566	75571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080173
1007	NC_011982	TCG	2	6	77880	77885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080174
1008	NC_011982	AGG	2	6	77920	77925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080174
1009	NC_011982	TCG	2	6	77928	77933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080174
1010	NC_011982	TCC	2	6	77958	77963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080174
1011	NC_011982	GGC	2	6	77981	77986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080174
1012	NC_011982	TGG	2	6	78037	78042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080174
1013	NC_011982	GC	3	6	78065	78070	0 %	0 %	50 %	50 %	222080174
1014	NC_011982	GAAC	2	8	78131	78138	50 %	0 %	25 %	25 %	222080174
1015	NC_011982	TGG	2	6	78151	78156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080174
1016	NC_011982	GAA	2	6	78563	78568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080175
1017	NC_011982	CGG	2	6	78613	78618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1018	NC_011982	CAT	2	6	78662	78667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1019	NC_011982	GCT	2	6	78680	78685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1020	NC_011982	CGC	2	6	78728	78733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080175
1021	NC_011982	TGG	2	6	78868	78873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080175
1022	NC_011982	CCG	2	6	78876	78881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080175
1023	NC_011982	TGG	2	6	78901	78906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080175
1024	NC_011982	AGC	2	6	78931	78936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1025	NC_011982	ACG	2	6	78951	78956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1026	NC_011982	ACG	2	6	79021	79026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1027	NC_011982	GC	3	6	79055	79060	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1028	NC_011982	TCGG	2	8	79095	79102	0 %	25 %	50 %	25 %	222080175
1029	NC_011982	GGC	2	6	79186	79191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1030	NC_011982	CG	3	6	79229	79234	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1031	NC_011982	ATC	2	6	79236	79241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1032	NC_011982	CAT	2	6	79280	79285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080175
1033	NC_011982	CTG	2	6	79287	79292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1034	NC_011982	GCGA	2	8	79314	79321	25 %	0 %	50 %	25 %	222080175
1035	NC_011982	CGGCT	2	10	79329	79338	0 %	20 %	40 %	40 %	222080175
1036	NC_011982	GGC	2	6	79354	79359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1037	NC_011982	GCA	2	6	79363	79368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1038	NC_011982	GAA	2	6	79395	79400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080175
1039	NC_011982	CTG	2	6	79401	79406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1040	NC_011982	GCT	2	6	79433	79438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1041	NC_011982	CGGC	2	8	79458	79465	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1042	NC_011982	GC	3	6	79547	79552	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
1043	NC_011982	CGG	2	6	79562	79567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1044	NC_011982	CGG	2	6	79609	79614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080175
1045	NC_011982	TGC	2	6	79663	79668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080175
1046	NC_011982	CGA	2	6	79768	79773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1047	NC_011982	CGCT	2	8	79799	79806	0 %	25 %	25 %	50 %	222080176
1048	NC_011982	GCG	2	6	79910	79915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1049	NC_011982	TCG	2	6	79922	79927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1050	NC_011982	GCG	2	6	79945	79950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1051	NC_011982	CT	3	6	79965	79970	0 %	50 %	0 %	50 %	222080176
1052	NC_011982	CAT	2	6	80018	80023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080176
1053	NC_011982	TGC	2	6	80035	80040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1054	NC_011982	GC	3	6	80081	80086	0 %	0 %	50 %	50 %	222080176
1055	NC_011982	AGCCC	2	10	80121	80130	20 %	0 %	20 %	60 %	222080176
1056	NC_011982	GCT	2	6	80164	80169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1057	NC_011982	TGC	2	6	80238	80243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1058	NC_011982	CAA	2	6	80263	80268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080176
1059	NC_011982	CGG	2	6	80333	80338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1060	NC_011982	GAC	2	6	80351	80356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1061	NC_011982	GTCGC	2	10	80455	80464	0 %	20 %	40 %	40 %	222080176
1062	NC_011982	GAT	2	6	80531	80536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080176
1063	NC_011982	TCG	2	6	80550	80555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080176
1064	NC_011982	CGG	2	6	80640	80645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080176
1065	NC_011982	GA	3	6	80667	80672	50 %	0 %	50 %	0 %	222080176
1066	NC_011982	CGCTC	2	10	80688	80697	0 %	20 %	20 %	60 %	222080177
1067	NC_011982	GCA	2	6	80727	80732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1068	NC_011982	GCT	2	6	80781	80786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1069	NC_011982	CGC	2	6	80928	80933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1070	NC_011982	CCGTG	2	10	81063	81072	0 %	20 %	40 %	40 %	222080177
1071	NC_011982	TGC	2	6	81122	81127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1072	NC_011982	GAAA	2	8	81258	81265	75 %	0 %	25 %	0 %	222080177
1073	NC_011982	GCC	2	6	81394	81399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1074	NC_011982	CGGC	2	8	81423	81430	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
1075	NC_011982	TCT	2	6	81444	81449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080177
1076	NC_011982	TGC	2	6	81473	81478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080177
1077	NC_011982	CG	3	6	81485	81490	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
1078	NC_011982	GCC	2	6	81597	81602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080177
1079	NC_011982	CGGT	2	8	81615	81622	0 %	25 %	50 %	25 %	222080177
1080	NC_011982	CCA	2	6	82009	82014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080178
1081	NC_011982	GTTC	2	8	82027	82034	0 %	50 %	25 %	25 %	222080178
1082	NC_011982	GC	3	6	82095	82100	0 %	0 %	50 %	50 %	222080178
1083	NC_011982	CCA	2	6	82123	82128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080178
1084	NC_011982	GCC	2	6	82179	82184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080178
1085	NC_011982	AGG	2	6	82201	82206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080178
1086	NC_011982	CGA	2	6	82232	82237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080178
1087	NC_011982	CCT	2	6	82240	82245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080178
1088	NC_011982	CGA	2	6	82280	82285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080178
1089	NC_011982	GCC	2	6	82493	82498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080179
1090	NC_011982	CGA	2	6	82546	82551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080179
1091	NC_011982	CGAGGA	2	12	82588	82599	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222080179
1092	NC_011982	CGAA	2	8	82968	82975	50 %	0 %	25 %	25 %	222080180
1093	NC_011982	CTT	2	6	83193	83198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080181
1094	NC_011982	TGG	3	9	83411	83419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080181
1095	NC_011982	CTG	2	6	83624	83629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080182
1096	NC_011982	CG	3	6	83632	83637	0 %	0 %	50 %	50 %	222080182
1097	NC_011982	GC	3	6	83655	83660	0 %	0 %	50 %	50 %	222080182
1098	NC_011982	T	7	7	83721	83727	0 %	100 %	0 %	0 %	222080182
1099	NC_011982	ATC	2	6	83869	83874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080183
1100	NC_011982	CGA	2	6	83923	83928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080183
1101	NC_011982	CCGA	2	8	83937	83944	25 %	0 %	25 %	50 %	222080183
1102	NC_011982	TCG	2	6	83945	83950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080183
1103	NC_011982	GTC	2	6	84003	84008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080183
1104	NC_011982	TCT	2	6	84133	84138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080183
1105	NC_011982	CCA	2	6	84166	84171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080183
1106	NC_011982	TCGC	2	8	84213	84220	0 %	25 %	25 %	50 %	222080183
1107	NC_011982	GCT	2	6	84221	84226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080183
1108	NC_011982	CGG	2	6	84227	84232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080183
1109	NC_011982	ATGTC	2	10	84304	84313	20 %	40 %	20 %	20 %	222080183
1110	NC_011982	TCCG	2	8	84355	84362	0 %	25 %	25 %	50 %	222080184
1111	NC_011982	GACG	2	8	84391	84398	25 %	0 %	50 %	25 %	222080184
1112	NC_011982	GCG	2	6	84444	84449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080184
1113	NC_011982	GC	3	6	84482	84487	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
1114	NC_011982	GCA	2	6	84492	84497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080184
1115	NC_011982	CGG	2	6	84521	84526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080184
1116	NC_011982	CGA	2	6	84550	84555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080184
1117	NC_011982	CGC	2	6	84606	84611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080184
1118	NC_011982	ACG	2	6	84669	84674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080184
1119	NC_011982	TCG	2	6	84693	84698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080184
1120	NC_011982	CCCG	2	8	84702	84709	0 %	0 %	25 %	75 %	222080184
1121	NC_011982	ATC	2	6	84746	84751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080184
1122	NC_011982	CG	4	8	84783	84790	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
1123	NC_011982	TCG	2	6	84827	84832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080184
1124	NC_011982	GC	3	6	84843	84848	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
1125	NC_011982	TGTC	2	8	84960	84967	0 %	50 %	25 %	25 %	222080184
1126	NC_011982	TCG	2	6	84983	84988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080184
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1250	NC_011982	GGA	2	6	92249	92254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080189
1251	NC_011982	CGG	2	6	92320	92325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080189
1252	NC_011982	TCG	2	6	92335	92340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080189
1253	NC_011982	CCG	2	6	92452	92457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080189
1254	NC_011982	ATC	2	6	92490	92495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080189
1255	NC_011982	CGG	2	6	92524	92529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080189
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1265	NC_011982	TCGA	2	8	93412	93419	25 %	25 %	25 %	25 %	222080191
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1365	NC_011982	ACA	2	6	99260	99265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080197
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1493	NC_011982	TGC	2	6	105984	105989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080203
1494	NC_011982	GAC	2	6	106021	106026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080203
1495	NC_011982	GCC	2	6	106118	106123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080203
1496	NC_011982	CGA	2	6	106144	106149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080203
1497	NC_011982	GGC	2	6	106150	106155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080203
1498	NC_011982	CTC	2	6	106208	106213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080203
1499	NC_011982	CGG	2	6	106245	106250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080203
1500	NC_011982	CGC	2	6	106305	106310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080203

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